Selain pertanian, Kecamatan Wawotobi memiliki potensi dalam bidang peternakan. Para peternak di wilayah ini dapat memanfaatkan limbah pertanian, seperti sisa tanaman jagung, sebagai pakan alternatif untuk ternak mereka. Pemanfaatan sumber daya lokal ini dapat meningkatkan efisiensi dan produktivitas peternakan.